YN87448病毒毒株全基因组序列及其克隆方法

摘要：

一种ＹＮ８７４４８病毒毒株全基因组序列及其克隆方法，该克隆方法将全基因分１５片段，用ＲＴ－ＰＣＲ方法扩增相应cＤＮＡ，连入pＧＥＭ－Ｔ载体，利用通用引物测序，在病毒基因序旬扩增引物设计上，选择甲病毒保守区域的核苷酸序列设计引物，引物３’末端尽可能终止在简并密码子较少的氨基酸位置且最后一个碱基终止在氨基酸密码子的第二位碱基，本发明从分子水平阐明了本病毒与其他流行株的差异，对了解病毒的来源进化过程及分子流行病学有重要意义。也表明：它是预防辛德毕斯脑炎流行的最佳制备疫苗的候选株。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN98120694.8

申请日期：1998-10-27

公开/公告号：CN1252445

公开/公告日：2000-05-10

主分类号：C12N15/11

申请/专利权人:中国预防医学科学院病毒学研究所

发明/设计人:梁国栋; 周国林; 李蕾; 付士红; 金奇; 张海林; 黄文丽; 侯云德

主申请人地址:100052北京市宣武区迎新街100号

专利代理机构:北京市专利事务所

代理人:郭佩兰

国别省市代码:北京;11

权利要求：

权利要求书1、一种YN87448病毒毒株全基因组序列，其特征在于：其全长包括11717个核苷酸（不包括5’端的帽子结构、3’端的多聚核苷酸尾）序列如下：ATTGGCGGCGTAGTACACACTATTGAATTAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTACCATTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGTAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGGACCGTACTTGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTACTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATTTACCACCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCATACAACACCAACTGGGCCGACGAAAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTTAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGGTCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACATACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGATACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCCGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATCGTCATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGCAGATCTTGACAATGAAAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACATATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGA