ALDH7A1基因SNP分子标记在乌骨鸡分子辅助育种中的应用

摘要：

本发明公开了一种ALDH7A1基因SNP分子标记在乌骨鸡皮肤乌色度分子辅助育种中的应用，ALDH7A1基因SNP分子标记位于NC_052572.1染色体Z上第83641675位，其为C或T多态，该位点在乌骨鸡中存在CC和TT两种基因型，其中TT基因型腿部皮肤亮度L*值显著低于CC基因型。在育种中可以将TT优势等位基因型作为选育腿部皮肤亮度L*值的重要分子标记，通过选留具有TT基因型个体，淘汰其他基因型个体的方法来辅助提高腿部皮肤乌色度的选育，加快腿皮乌色度世代选育进展。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN202311042987.9

申请日期：2023-08-18

公开/公告号：CN117004738A

公开/公告日：2023-11-07

主分类号：C12Q1/6888(2018.01)

申请/专利权人:江苏省家禽科学研究所%泰和凤升农牧科技有限公司

发明/设计人:束婧婷;屠云洁;章明;巨晓军;单艳菊;姬改革;刘一帆;盛中伟;肖芹;邹剑敏;赵伟东;郑国庆

主申请人地址:225000 江苏省扬州市邗江区仓颉路58号;

专利代理机构:南京源点知识产权代理有限公司

代理人:陈彩霞

权利要求：

1.ALDH7A1基因SNP分子标记在乌骨鸡皮肤乌色度分子标记辅助育种中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记位于NC_052572.1染色体Z上第83641675位，为C或T多态。 2. 根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的引物的核苷酸序列为： F：5’TGCCATACCACTGCCAGTGT 3’ R：5’CAGTTGTGCATCGCTGACCC 3’。 3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的筛选方法为： 采用基于飞行时间质谱分析技术的MassARRAY平台对黑色素沉积相关基因的60个SNP位点在丝羽乌骨鸡母鸡192个个体中进行基因分型，剔除没有多态性的SNP位点；使用SPSS16.0软件的一般线性模型中的单变量方差分析进行多态性位点基因型与肤色亮度L*值关联分析；筛选到ALDH7A1基因的1个SNP位点具有多态性，分析该SNP标记与皮肤肤色亮度L*值性状的相关性，该SNP位点TT基因型大腿部皮肤亮度L*值显著低于CC基因型，说明TT基因型个体大腿部皮肤乌色度较高；不同基因型个体间背部皮肤和胸部皮肤亮度L*值差异不显著；TT为腿部皮肤乌色度的优势基因型，通过选留具有TT基因型个体，淘汰其他基因型个体的方法来辅助提高腿部皮肤乌色度的选育。 4.根据权利要求1至3中任一项所述的应用，其特征在于，乌骨鸡皮肤乌色度分子标记辅助育种方法包括如下步骤： （1）提取待测鸡基因组总DNA； （2）根据SNP分子标记，利用引物对通过PCR方法扩增目标序列，所述SNP分子标记位于NC_052572.1染色体Z上第83641675位，所述引物对的序列为： F：5’TGCCATACCACTGCCAGTGT 3’ R：5’CAGTTGTGCATCGCTGACCC 3’； （3）将PCR扩增产物测序后，判断基因型； （4）根据基因型结果，选留腿部皮肤乌色度较高的优势基因型个体。 5. 根据权利要求4所述的应用，其特征在于，步骤（3）中，PCR扩增产物的核苷酸序列如SEQ NO.1或SEQ NO.2所示，PCR产物长度为324 bp。 6.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，步骤（4）中，SNP位点基因型对应的腿部皮肤乌色度较高的优势基因型为TT。