ATP11A基因中与公猪精液质量性状相关的SNP分子标记、引物对及其应用
本发明公开了一种ATP11A基因中与公猪精液质量性状相关的SNP分子标记、引物对及其应用，涉及猪分子标记技术领域。所述公猪精液品质性状为精液量、精子密度和精子活率等性状；所述分子标记位于猪ATP11A基因启动子区域中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第421bp处存在一处A421‑G421碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行公猪精液性状筛选和/或猪育种的方法。本发明首次发掘了猪ATP11A基因中的一个SNP分子标记与公猪精液品质性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪ATP11A基因中一个SNP分子标记在公猪精液品质性状的标记辅助育种的新用途，实现了对公猪繁殖性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
发明专利
CN202310793701.4
2023-06-30
CN116790764A
2023-09-22
C12Q1/6888(2018.01)
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
张宇;雷润雨;冯越;梅书棋;彭先文;吴俊静;乔木;周佳伟;徐忠;李梓芃;孙华;李良华;赵海忠;宋忠旭
430064 湖北省武汉市洪山区南湖瑶苑特4号畜牧所
佛山知正知识产权代理事务所(特殊普通合伙)
陶铸
湖北;42
1.一种ATP11A基因中与公猪精液质量性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述精液性状为单次采精量性状；所述分子标记位于猪ATP11A基因启动子区域中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第421bp处存在一处A421-G421碱基突变。 2.根据权利要求1所述的ATP11A基因中与公猪精液质量性状相关的SNP分子标记，其特征在于，序列SEQ ID NO.1中第421bp处的A或G碱基多态性位点，表现为AA、AG或GG三种基因型，其中A等位基因为优势等位基因。 3.如权利要求1或2任一项所述的SNP分子标记在公猪精液性状筛选和/或猪育种中的应用。 4.一种用于扩增如权利要求1所述的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。 5.如权利要求4所述的引物对在公猪精液性状筛选和/或猪育种中的应用。 6.一种利用如权利要求1所述的SNP分子标记进行快速选育的试剂盒，其特征在于，包含如权利要求4所述的引物对。 7.一种公猪精液性状筛选和/或猪育种的方法，其特征在于，包括以下步骤： S1、提取公猪的基因组DNA； S2、以步骤S1得到的基因组DNA作为模板，采用如权利要求4所述的引物对进行PCR扩增，得到如权利要求1所述的分子标记并纯化； S3、对步骤S2纯化后的分子标记进行测序分析，保留该序列第421bp处携带有A等位基因的个体，淘汰携带有G等位基因的个体。 8.根据权利要求7所述公猪精液性状筛选和/或猪育种的方法，其特征在于，步骤S1中，从待测公猪的耳缘组织中提取基因组DNA。 9.根据权利要求7所述公猪精液性状筛选和/或猪育种的方法，其特征在于，步骤S2中，PCR反应体系50μL，体系中各组分为：基因组DNA 100ng、PCR mix 25μL、上游引物、下游引物各1μL、加ddH2O补至总体积50μL；PCR的运行程序为：94℃预变性3min；94℃变性30s，56℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。