ATAC-seq介导精准靶向编辑在水稻抗病中的应用
本发明公开了ATAC‑seq介导精准靶向编辑在水稻抗病中的应用，属于基因编辑技术领域。本发明基于ATAC‑seq，精准靶点设计八个位点，其中四个位点在高ATAC‑seq区域，另外四个靶位点位于低ATAC‑seq区域，提升工作效率，可以实现基因的精准编辑。本发明基于ATAC‑seq结合基因编辑，提高原先靶点设计的精准性以及特异性，可应用于水稻抗病基因的筛选和验证，并精准调控基因表达，实现水稻抗病的目的。
发明专利
CN202310436831.2
2023-04-21
CN116516051A
2023-08-01
C12Q1/6895(2018.01)
华中农业大学
李国田;韩欣雨;沙干
430070 湖北省武汉市洪山区狮子山街1号
北京高沃律师事务所
王儒
湖北;42
1.ATAC-seq预测结合靶向基因编辑在筛选功能基因和/或鉴定基因功能中的应用。 2.一种筛选功能基因的方法，其特征在于，包括以下步骤：在目标基因的启动子区进行ATAC-seq预测，在高ATAC-seq区域和低ATAC-seq区域内各选择4个基因编辑靶位点，分别构建基因编辑载体； 分别将各基因编辑载体转化宿主，对基因编辑后的目标事件进行功能鉴定，得功能基因。 3.根据权利要求2所述方法，其特征在于，所述目标基因包括植物基因。 4.根据权利要求2所述方法，其特征在于，所述基因编辑靶位点包括基因敲低和/或敲除靶位点。 5.根据权利要求2所述方法，其特征在于，所述功能鉴定包括抗性鉴定。 6.一种鉴定基因在植物抗病性中作用的方法，其特征在于，包括以下步骤： 对待测基因的启动子区进行ATAC-seq预测，在高ATAC-seq区域和低ATAC-seq区域内各选择4个靶位点，分别构建基因敲除和/或敲低载体； 分别将所述基因敲除和/或敲低载体转化植物，对转化后的植株进行抗病性鉴定。 7.根据权利要求6所述方法，其特征在于，所述抗病性鉴定包括鉴定对真菌和/或细胞引发的疾病的抗性。 8.根据权利要求7所述方法，其特征在于，当所述植物为水稻时，所述抗病性鉴定包括鉴定对稻瘟病和/或白叶枯病的抗性。 9.根据权利要求6所述方法，其特征在于，得到所述抗病性鉴定的结果后，还包括与ATAC-seq预测进行结合。 10.ATAC-seq预测结合靶向基因编辑在构建不同抗性植物种质中的应用。