6号染色体上与水稻黑条矮缩病抗性主效QTL紧密连锁的InDel标记及其应用
本发明提供一种水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记，包括第一和第二分子标记，分别包括qRBSDV6M1 forward和qRBSDV6M1 reverse所示的第一引物对，以及qRBSDV6M2 forward和qRBSDV6M2 reverse所示的第二引物对。还提供了相关的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，位于水稻的6号染色体。还提供了相关应用。本发明的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记可以检测水稻黑条矮缩病抗性的高低，可以预测水稻黑条矮缩病抗性的高低，可以对水稻黑条矮缩病抗性的高低进行有效选择，还可以用于高抗黑条矮缩病水稻的分子标记辅助育种，加速水稻抗病育种的进程，设计巧妙，检测简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。
发明专利
CN202111648051.1
2021-12-30
CN116426663A
2023-07-14
C12Q1/6895(2018.01)
江苏省农业科学院
周彤;林峰;刘斌;赵均良
210014 江苏省南京市玄武区钟灵街50号江苏省农业科学院
江苏;32
1.一种与水稻黑条矮缩病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记，其特征在于：所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记包括第一分子标记qRBSDV6M1和第二分子标记qRBSDV6M2，所述第一分子标记包括qRBSDV6M1 forward和qRBSDV6M1 reverse所示的第一引物对，所述第二分子标记包括qRBSDV6M2 forward和qRBSDV6M2 reverse所示的第二引物对。 2.一种水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，其特征在于，所述水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点与水稻的第6染色体的第一分子标记和第二分子标记紧密连锁，所述第一分子标记包括qRBSDV6M1 forward和qRBSDV6M1 reverse所示的第一引物对，所述第二分子标记包括qRBSDV6M2 forward和qRBSDV6M2 reverse所示的第二引物对。 3.如权利要求2所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，其特征在于，所述水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点与水稻黑条矮缩病抗性连锁的显著性P值为3.24E-06。 4.一种利用分子标记检测水稻黑条矮缩病抗性的方法，其特征在于，包括以下步骤： (1)提取待测水稻的基因组DNA； (2)分别采用根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性QTL位点的分子标记对所述基因组DNA进行PCR扩增； (3)如果采用所述第一分子标记扩增出132bp扩增产物，且采用所述第二分子标记扩增出120bp扩增产物，则所述待测水稻为抗黑条矮缩病水稻，否则，所述待测水稻为不抗黑条矮缩病水稻。 5.一种利用分子标记辅助高抗黑条矮缩病水稻育种的方法，其特征在于，包括以下步骤： (1)提取待测水稻的基因组DNA； (2)分别采用根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病主效QTL位点的分子标记对所述基因组DNA进行PCR扩增； (3)如果采用所述第一分子标记扩增出132bp扩增产物，且采用所述第二分子标记扩增出120bp扩增产物，则所述待测水稻为高抗黑条矮缩病水稻，将所述高抗黑条矮缩病水稻应用于水稻抗病育种。 6.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记在检测水稻黑条矮缩病抗性高低中的应用。 7.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记在预测水稻黑条矮缩病抗性高低中的应用。 8.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记在对水稻黑条矮缩病抗性高低进行选择中的应用。 9.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的分子标记在水稻黑条矮缩病抗性分子标记辅助育种中的应用。