6号染色体上与水稻黑条矮缩病抗性主效QTL紧密连锁的单倍型标记

摘要：

本发明提供一种水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记，水稻6号染色体914797，965164和1149209位点处的碱基分别为A，G，T。提供了相关的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，位于水稻的6号染色体。还提供了相关应用。本发明的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记可以检测水稻黑条矮缩病抗性的高低，可以预测水稻黑条矮缩病抗性的高低，可以对水稻黑条矮缩病抗性的高低进行有效选择，还可以用于高抗黑条矮缩病水稻的分子标记辅助育种，加速水稻抗病育种的进程，设计巧妙，不受环境影响，适于大规模推广应用。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN202111647890.1

申请日期：2021-12-30

公开/公告号：CN116426662A

公开/公告日：2023-07-14

主分类号：C12Q1/6895(2018.01)

申请/专利权人:江苏省农业科学院

发明/设计人:周彤;赵均良;刘斌;林峰

主申请人地址:210014 江苏省南京市玄武区钟灵街50号江苏省农业科学院

国别省市代码:江苏;32

权利要求：

1.一种与水稻黑条矮缩病抗性主效QTL紧密连锁的单倍型标记，其特征在于：所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记包括6号染色体914797，965164和1149209位点处的碱基分别为A，G，T。 2.一种水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，其特征在于，所述水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点与水稻的第6染色体的单位型标记紧密连锁，所述单倍型标记6号染色体914797，965164和1149209位点处的碱基分别为A，G，T。 3.如权利要求2所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点，其特征在于，所述水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点与水稻黑条矮缩病抗性连锁的显著性P值为3.24E-06。 4.一种利用单倍型标记检测水稻黑条矮缩病抗性的方法，其特征在于，包括以下步骤： (1)提取待测水稻的基因组DNA； (2)对水稻基因组进行重测序，根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性QTL位点的单倍型标记对所述基因组DNA进行分析； (3)如果待测水稻6号染色体914797，965164和1149209位点处的碱基分别为A，G，T，则所述待测水稻为抗黑条矮缩病水稻，否则，所述待测水稻为不抗黑条矮缩病水稻。 5.一种利用单倍型标记辅助高抗黑条矮缩病水稻育种的方法，其特征在于，包括以下步骤： (1)提取待测水稻的基因组DNA； (2)对水稻基因组进行重测序，根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性QTL位点的单倍型标记对所述基因组DNA进行分析； (3)如果待测水稻6号染色体914797，965164和1149209位点处的碱基分别为A，G，T，则所述待测水稻为抗黑条矮缩病水稻，否则，所述待测水稻为不抗黑条矮缩病水稻。 6.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记在检测水稻黑条矮缩病抗性高低中的应用。 7.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记在预测水稻黑条矮缩病抗性高低中的应用。 8.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记在对水稻黑条矮缩病抗性高低进行选择中的应用。 9.根据权利要求1所述的水稻黑条矮缩病抗性主效QTL位点的单倍型标记在水稻黑条矮缩病抗性分子标记辅助育种中的应用。