ctDNA甲基化建库的标签接头、引物组、试剂盒和建库方法

摘要：

本发明属于分子基因组学技术领域，具体公开了一种用于ctDNA甲基化建库的标签接头、引物组、试剂盒和建库方法。所述标签接头包括上游双链标签接头A和下游双链标签接头P1；所述引物组由上游扩增引物和下游扩增引物组成；所述试剂盒包括所述标签接头和引物组；所述建库方法包括ctDNA提取、重亚硫酸盐转化及纯化、末端修复、接头连接、文库扩增和上机测序等步骤。本发明设计了144种标签序列，可满足同时操作上百个样品的需求，为批量建库提供充足的标签接头。本发明所提供的建库方法有较好的兼容性，适用于常见的二代测序平台；操作灵活简便，具有检测灵敏度高、高效快捷、节约成本的优点，有较好的应用推广前景。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201711449169.5

申请日期：2017-12-27

公开/公告号：CN108103060A

公开/公告日：2018-06-01

主分类号：C12N15/11(2006.01)I

申请/专利权人:广州赛哲生物科技股份有限公司

发明/设计人:伍泳彰;陈杰

主申请人地址:510320 广东省广州市国际生物岛螺旋四路一号

专利代理机构:广州粤高专利商标代理有限公司 44102

代理人:单香杰

国别省市代码:广东;44

权利要求：

 一种用于ctDNA甲基化建库的标签接头，其特征在于，包括由单链正向序列A‑BN‑Forward和单链反向序列A‑BN‑Reverse组成的上游双链标签接头A以及由单链正向序列P1‑Forward和单链反向序列P1‑Reverse组成的下游双链标签接头P1，其核苷酸序列依次如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:4所示；所述上游双链标签接头A中的M和V代表由10～12个碱基组成的标签序列Barcode；其中，M的核苷酸序列选自SEQ ID NO:5～SEQ ID NO:148中的任意一条，V为M的互补序列。