G形夹用于改进的等位基因特异性PCR的用途

摘要：

本发明包括利用等位基因特异性寡核苷酸的等位基因特异性扩增方法，所述等位基因特异性寡核苷酸与靶序列的多于一种变体至少部分互补，但具有与靶序列的仅一种变体互补的至少一个选择性核苷酸，并且掺入至少一个“G形夹”核苷酸。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201710514760.8

申请日期：2012-09-12

公开/公告号：CN107267615A

公开/公告日：2017-10-20

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:霍夫曼－拉罗奇有限公司

发明/设计人:V.博德普迪;N.舍恩布伦纳;A.湛

主申请人地址:瑞士巴塞尔

专利代理机构:中国专利代理(香港)有限公司 72001

代理人:任晓华%鲁炜

国别省市代码:瑞士;CH

权利要求：

靶序列变体的等位基因特异性扩增的方法，所述靶以几种变体序列的形式存在，所述方法包括：(a) 使第一和第二寡核苷酸与所述靶序列的至少一种变体杂交；其中所述第一寡核苷酸与所述靶序列的一种或多种变体至少部分互补，并且所述第二寡核苷酸与所述靶序列的一种或多种变体至少部分互补，并且在3'末端处具有与所述靶序列的仅一种变体互补的一个选择性核苷酸；其中所述第二寡核苷酸在3'末端核苷酸上游的1‑5个核苷酸的位置处掺入至少一个包含9‑(氨基乙氧基)‑吩噁嗪‑2'‑脱氧胞苷的核苷酸；(b) 用核酸聚合酶延伸所述第二寡核苷酸，其中当所述第二寡核苷酸与和所述在3'末端处的一个选择性核苷酸互补的所述靶序列变体杂交时，所述聚合酶能够有效延伸所述第二寡核苷酸，并且当所述第二寡核苷酸与和所述在3'末端处的一个选择性核苷酸不互补的所述靶序列变体杂交时，则延伸效率明显更低；其中所述核酸聚合酶具有3'‑5'核酸酶活性。