ctDNA的数字化深度测序技术

摘要：

本发明涉及用于cfDNA建库的接头、cfDNA建库方法及试剂盒。本发明的接头中含有2‑9碱基随机序列，构成数字信号，可用于在构建文库时给不同来源的相同序列DNA分子加上含有不同数字信号的接头，从而区分测序结果中的不同来源的相同序列DNA分子。使用本发明的含有数字信号的接头可以在相同测序深度下增加有效测序深度，降低NGS检测过程中的错误底噪、提高检测下限，同时达到较高的灵敏度。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201710017802.7

申请日期：2017-01-11

公开/公告号：CN106701956A

公开/公告日：2017-05-24

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:上海思路迪生物医学科技有限公司

发明/设计人:李福根;熊磊;陈阅军;汤先念;金其煌;覃灏;许青

主申请人地址:201114 上海市闵行区新骏环路158号2幢304室

专利代理机构:北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 11003

代理人:尹振启

国别省市代码:上海;31

权利要求：

用于cfDNA建库的含有数字信号的接头，所述含有数字信号的接头包括两种接头序列，所述两种接头序列是在下述的P5和P7接头序列的基础上进行序列修饰得到的：P5：5'‑AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC‑ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT‑3'P7：5'‑GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACG‑index‑ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG‑3'；其中：两种接头序列中的一种是多种序列的混合物，组成混合物的每种序列分别是在上述P5接头序列的5'端第29位的C和第30位的A之间插入n碱基随机序列得到的序列且每种序列中的n碱基随机序列各不相同，两种接头序列中的另一种是上述P7接头序列；或者两种接头序列中的一种是多种序列的混合物，组成混合物的每种序列分别是用n碱基随机序列取代上述P7接头序列中的index序列得到的序列且每种序列中的n碱基随机序列各不相同，两种接头序列中的另一种是上述P5接头序列；其中n是选自2‑9的任一个数字。