DNA集合的归一化迭代条形码和测序

摘要：

本发明尤其提供用于由多个原始含核酸的样品制备线性、非选择性扩增的DNA片段的统一库的组合物和方法，其中来自所述多个原始样品中的每一个的所述片段的比例表述为归一化的并且所述库是以高度并行化、基于池方式产生。本发明尤其用于制备如下库：其中特定信息经编码而使由所述库的高通量测序衍生的较短测序读序被分析或组合成较长级序列，所述较长级序列在可能的极大型样品集合中完全可追踪到原始含核酸的样品。本发明的组合物涵盖本文所述的多种构筑体，其可与一种或多种用于本发明方法中的另外试剂和使用说明书一起以不同方式封装。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201680010540.5

申请日期：2016-01-16

公开/公告号：CN107250381A

公开/公告日：2017-10-13

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:斯库维尔公司

发明/设计人:约瑟夫·C·梅勒;杰克·T·莱昂纳德

主申请人地址:美国马萨诸塞州

专利代理机构:中原信达知识产权代理有限责任公司 11219

代理人:金海霞%杨青

国别省市代码:美国;US

权利要求：

一种由多个样品获得DNA片段的迭代标记库的方法，所述方法包含：(a)使所述多个样品的第一样品和第二样品中的靶核酸分子分别与均一和限定量的各自包含可鉴别的样品序列标记的第一构筑体和第二构筑体接触，其中所述第一构筑体中的所述样品序列标记与所述第二构筑体中的所述样品序列标记不同，并且所述接触会进行一定持续时间并在如下条件下进行：其中所述第一构筑体中的所述样品序列标记被整合到所述第一样品中的所述核酸分子中，并且所述第二构筑体中的所述样品序列标记被整合到所述第二样品中的所述核酸分子中；(b)汇集所述第一样品和第二样品以产生经样品标记的核酸分子的池；(c)使所述经样品标记的核酸分子的池与包含池标记的第三构筑体接触，其中所述接触会进行一定持续时间并在如下条件下进行：其中所述池标记以按照核苷酸的规定频率被整合到所述池的核酸分子中，由此生成经样品标记的、经池标记的核酸分子的池；以及(d)用寡核苷酸扩增所述经样品标记的、经池标记的核酸分子，由此生成DNA片段的迭代标记库，所述寡核苷酸包含(i)与所述经样品标记的、经池标记的核酸分子中的核酸序列互补的核酸序列，和(ii)适用于下一代测序的核酸序列。