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HRM技术检测氯吡格雷用药相关基因多态性的方法

引用
本发明公开了一种HRM技术检测氯吡格雷用药相关基因多态性的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:采用硅胶吸附法抽提被测者口腔上皮细胞/外周血细胞样本的基因组DNA,设计包含目标位点的检测引物,根据HRM技术对PCR扩增后的基因序列进行位点分型。本发明灵敏度高、特异性好,检测速度快,可用于评估患者使用氯吡格雷治疗的有效性,从而达到合理有效地个体化用药。

发明专利

CN201410815918.1

2014-12-25

CN104450935A

2015-03-25

C12Q1/68(2006.01)I

上海中优医药高科技有限公司

张奕;毛丹丹;卞雪莲

200444 上海市宝山区沪太路3100号E座4楼

上海;31

一种HRM分析技术检测氯吡格雷用药相关基因多态性的方法,其特征在于,具体步骤为:第一步: 采用硅胶吸附法抽提被测者口腔上皮细胞/外周血细胞样本的基因组DNA,电泳凝胶成像法对DNA的浓度和纯度作检测,待测样本浓度标化到10ng/ul;第二步:采用在线软件Primer 3设计HRM引物,确定最佳引物为18‑25bp大小,PCR产物长度80‑150bp,相关引物信息如下:CYP2C19  G681A引物序列:G681A‑F:TGCAATTTTCCCACTATCATTGG681A‑R:TTGGTGTTCTTTTACTTTCTCCAACYP2C19  G636A引物序列:G636A ‑F:CGTTTCGATTATAAAGATCAGCAG636A ‑R:AAAGACTGTAAGTGGTTTCTCAGGAABCB1  C3435T引物序列:C3435T‑F:CCTGTTTGACTGCAGCATTGC3435T‑R:GCTCCCAGGCTGTTTATTTG第三步:在每一个PCR反应孔中依次加入Type‑it HRM PCR Mix 7.5ul,正、反向引物溶液各0.5ul(10umol/L),检测样品2ul,用灭菌重蒸馏水补足15ul;在Rotor‑Gene Q上进行反应,PCR反应条件为92‑97℃变性5‑15分钟,92‑97℃变性10‑30秒,57‑65℃退火10‑30秒,70‑75℃延伸10‑30秒,30‑50个循环;HRM反应条件:92‑97℃变性1分钟,40℃复性1分钟,初始熔解温度60‑65℃开始程序升温熔解至95℃,过程中实时监测荧光信号,30‑50次每秒;第四步:应用Rotor‑Gene Q软件分析HRM结果,通过标准曲线基于曲线偏移(纯合子)和曲线形状变化(杂合子)展现不同的基因型;定义已知样本基因型后,软件会自动调出所有检测样本的基因型。
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2015-03-25公开
2017-01-11发明专利申请公布后的视为撤回
2015-04-22实质审查的生效
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