HGF基因的Poly A重复单元数目突变多态性检测用探针及其用途
本发明提供HGF基因的poly?A重复单元数目突变多态性检测用探针及其用途。所述多态性检测用探针为用于检测HGF基因的多态性的探针,其由(P1-1)、(P1-2)、(P1’-1)、(P1’-2)、(P2-1)、(P2-2)、(P2’-1)、(P2’-2)、(P3-1)、(P3-2)、(P3’-1)和(P3’-2)中的至少一种荧光标记寡核苷酸构成。例如(P1-1)为如下荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95~100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95~100的3’末端和所述碱基编号132之间的1~31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8~94个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记。
发明专利
CN201210150146.5
2012-05-09
CN102776277A
2012-11-14
C12Q1/68(2006.01)I
爱科来株式会社
井口亚希;平井光春
日本京都府
北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258
肖善强
日本;JP
一种多态性检测用探针,其是用于检测HGF基因的多态性的探针,其特征在于,其由从下述(P1?1)、(P1?2)、(P1’?1)、(P1’?2)、(P2?1)、(P2?2)、(P2’?1)、(P2’?2)、(P3?1)、(P3?2)、(P3,?1)和(P3’?2)的组中选择的至少一种荧光标记寡核苷酸构成:(P1?1)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95~100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95~100的3’末端和所述碱基编号132之间的1~31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8~94个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记;(P1?2)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95~100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95~100的3’末端和所述碱基编号132之间的1~31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8~94个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下,与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交,并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记;(P1’?1)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95~100以及由夹在所述碱基编号95~100的3’末端和碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为7~55个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性,与所述碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记;(P1’?2)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95~100以及由夹在所述碱基编号95~100的3’末端 和碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为7~55个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下,与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交,并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记;(P2?1)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92~100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号92~100的3’末端和所述碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为11~94个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记;(P2?2)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92~100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号92~100的3’末端和所述碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为11~94个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下、与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交,并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记;(P2’?1)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92~100以及由夹在所述碱基编号92~100的3’末端和碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为10~55个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下、相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记;(P2’?2)荧光标记寡核苷酸,其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92~100以及由夹在所述碱基编号92~100的3’末端和碱基编号132之间的1~31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为10~55个碱基长的碱基序列互补,其在与碱基编号92对 应的碱基为胞嘧啶的条件下,与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交,与所述碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记;(P3?1)荧光标记寡核苷酸,其为8~120个碱基长的碱基序列,且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号100、碱基编号132~134、以及由夹在所述碱基编号100和所述碱基编号132~134的5’末端之间的4~31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列,其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于序列编号3的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记;(P3?2)荧光标记寡核苷酸,其为8~120个碱基长的碱基序列,且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号100、碱基编号132~134、以及由夹在所述碱基编号100和所述碱基编号132~134的5’末端之间的4~31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列,其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下,和与序列编号3互补的碱基序列在严谨条件下杂交,并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记;(P3’?1)荧光标记寡核苷酸,其为8~56个碱基长的碱基序列,且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号132~134以及由夹在碱基编号100和所述碱基编号132~134的5’末端之间的5~31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列,其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下,相对于序列编号3的碱基序列具有至少80%以上的同一性,并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记;(P3’?2)荧光标记寡核苷酸,其为8~56个碱基长的碱基序列,且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号132~134以及由夹在碱基编号100和所述碱基编号132~134的5’末端之间的5~31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列,其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下,和与序列编号3互补的碱基序列在严谨条件下杂交,并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记。