EGFR基因的多态性检测用探针、扩增用引物及其应用

摘要：

本发明提供了能够简便且以优秀的可信度来判别关于EGFR基因中不同多态性的多态性检测用探针、扩增用引物及其用途。选自P1、P3、P5～P7及P15～P18中的至少一种经荧光标记的寡核苷酸作为多态性检测用探针来使用。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201110348377.2

申请日期：2011-10-31

公开/公告号：CN102559866A

公开/公告日：2012-07-11

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:爱科来株式会社

发明/设计人:井口亚希;伊集院萌子

主申请人地址:日本京都府

专利代理机构:北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258

代理人:肖善强

国别省市代码:日本;JP

权利要求：

多态性检测用探针，所述探针是能检测EGFR基因的突变的探针，其特征在于所述探针包括选自下述P1、P3、P5～P7以及P15～P18中的至少一种经荧光标记的寡核苷酸：(P1)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号251～261的11～50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶，与碱基编号251对应的碱基为胞嘧啶，所述胞嘧啶被荧光色素标记；(P3)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号257～261的5～50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶，与碱基编号257对应的碱基为胞嘧啶，所述胞嘧啶被荧光色素标记；(P5)寡核苷酸，其具有与含有序列编号2所示的碱基序列中碱基编号104～112的9～50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号112同源的碱基为胸腺嘧啶，与碱基编号104同源的碱基为胞嘧啶，所述胞嘧啶被荧光色素标记；(P6)寡核苷酸，其具有与含有序列编号2所示的碱基序列中碱基编号104～119的16～50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列，其中，碱基编号119的碱基被G以外的碱基替换，与碱基编号104同源的碱基为胞嘧啶，所述胞嘧啶被荧光色素标记；(P7)寡核苷酸，其具有与含有序列编号3所示的碱基序列中碱基编号136～145的10～50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号145同源的碱基为胞嘧啶，所述胞嘧啶被荧光色素标记；(P15)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号259～264的6～50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶，位于所述碱基3’侧的胞嘧啶被荧光色素标记；(P16)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基 编号258～262的5～50个碱基长的碱基序列互补的序列或与所述互补的序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261对应的碱基为腺嘌呤或胞嘧啶，位于所述碱基5’侧的胞嘧啶被荧光色素标记；(P17)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号249～264的16～50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261同源的碱基为胸腺嘧啶或鸟嘌呤，位于所述碱基5’侧的胞嘧啶被荧光色素标记；(P18)寡核苷酸，其具有与含有序列编号1所示的碱基序列中碱基编号257～264的8～50个碱基长的碱基序列具有同源性的序列，其中，与碱基编号261同源的碱基为胸腺嘧啶或鸟嘌呤，位于所述碱基3’侧的胞嘧啶被荧光色素标记。