KIT信号相关基因QPCR芯片
本发明属于生物技术领域,涉及一种用于KIT信号相关基因检测的QPCR芯片。一种KIT信号相关基因QPCR芯片,其特征在于:所述芯片以Akt1、Bcl2、Cbl、Ccnd3、Ccnd3-ps、Csf1、Crk、Ecm1、Fes、Fyn、Grb7、Hras1、Jak1、Kitl、Lyn、Map2k、Matk、Myb、Nr0b2、Ntrk1、Pdgfa、Pik3ca、Ppp1r13b、Prkcc、Raf1、Sh2b2、Shc1、Snai2、Soat1、Stat1、Zhx2基因为检测位点,以Actb为内参。本发明针对现有技术的缺陷及KIT信号研究的实际需求提供一种KIT信号相关基因QPCR芯片,该KIT信号相关基因QPCR芯片可以用于检测KIT信号相关基因表达丰度的变化,还可以根据不同信号通路的要求对个别基因加以修改,具有一定的灵活性,解决了现有的基因芯片针对性差、通量高而价格昂贵的技术缺陷。
发明专利
CN201110242503.6
2011-08-23
CN102296115A
2011-12-28
C12Q1/68(2006.01)I
杭州师范大学
吴宝金
310036 浙江省杭州市下沙高教园区学林街16号
杭州杭诚专利事务所有限公司 33109
王江成%朱实
浙江;33
一种KIT信号相关基因QPCR芯片,其特征在于:所述芯片以Akt1、Bcl2、Cbl?、Ccnd3、Ccnd3?ps、Csf1、Crk、Ecm1、Fes、Fyn、Grb7、Hras1、Jak1、Kitl、Lyn、Map2k、Matk、Myb、Nr0b2、Ntrk1、Pdgfa、Pik3ca、Ppp1r13b、Prkcc、Raf1、Sh2b2、Shc1、Snai2、Soat1、Stat1、Zhx2基因为检测位点,以Actb为内参,以以下32个基因的上游引物和下游引物为基础检测特定基因的表达水平:基因名称上游引物下游引物ActbF: AGATGACCCAGATCATGTTTGAGAR: AGATGACCCAGATCATGTTTGAGA???? Akt1? F:TGAGGAGCGGGAAGAATGG? R:GGTGAGCCTGATCGGAAGTCBcl2? F: GAGGCTGGGATGCCTTTGT?????????????? R:CCAGGTATGCACCCAGAGTGACblF: GAGCGCCGGCGGTGGTTGC???????????? R: GGAATGGAGCCGGGCGAGAAGGA?????? Ccnd3?? F: TGCGTGCAAAAGGAGATCAA???????? R: CACACACCTCCAGCATCCAGTACcnd3?psF: CCTGTCTCTGCCCAGTGGTT?? R: CCAAAAAGTCTGGGCATGCT???????????????? CrkF:CCAACCCAGCGTCAACACT???? R:GCTCACCGACCTCCAAAGC???? Csf1F: GCAGCAGTTGATCGACAGTCA???? R: CGCATGGTCTCATCTATTATGTCTTG? Ecm1F: TGCCGCAGCGACACAA????????????????? R: CATTGCATCCTCCCACACAAGFesF: AGCAAGGATCCTGAAACAGTACAA??? R: TGTGCAGACCCCGATGAGA?????????????????? Fyn?????? F:CCATACCCAGGCATGAACAAC????? R:GTGGGCAGGGCATCCTATAG?? ?Grb7F: CTGGATGCACAAACAGGCATA?????? R: TGCAGGAAGCCCTGGATCTHras1F: CAAGCTGGCGTGGAGGATR: CGCAATTTATGCTGCCGAATJak1F: CCGCATGAGGTTCTACTTTACCAR: TGTCGCCATACAGACTGTTCGTKitlF: GCACAGTGGCTGGTAACAGTTCR: GAACAGGTAAGGATGAGGTCTGTCALynF: CTACGTGGCCAAGGTCAACA?? R:CTGTCGCTCTGCATCTTTCCTMap2kF: ACAGAGATGTGAAGCCCTCCAAR: CCCCGAAGTCACACAGCTTAAMatkF: GCAGTTTGCTCTTCATGTTGCTR: CAAGTCCTCAGAGACCAGGATGTMybF: CTGAACCCTGAACTCATCAAAGGR: GACCAACGCTTCGGACCATANr0b2F: GAGCTGGGTCCCAAGGAGTATR: GCACATCTGGGTTGAAGAGGATNtrk1F: TCTGGGAGATCTTCACCTATGGAR: CGATCGCCTCAGTGTTGGAPdgfaF: GTGCGACCTCCAACCTGAAR:GCTCATCTCACCTCACATCTGTCTPik3caF: CGAGATATATGATGCAGCCATTGR: AGATAAAGGTTGCCACGCAGTACPpp1r13bF: TGCTGGACTTTGGTGTCAATGR: GCAAGAGGCAGCACAATGCPrkccF: AGCAACTGGGCAAGTTTAAGGAR: GAAGAAGAGGCCTATGGCGATTRaf1F: AGCTTCCCTACGCCCACATR:ACCCACGGCCTACCATGASerpina1cF: CTGGACCAAGACACAGTTTTCGR: GCTTCTTCCATTTGCCTTTAAAGASh2b2F: TCCGCCTGGAGTTCTTCGTR: GTGTTGTCCTTTTCAGGCATTTCShc1F: GCCGACTGCAAACAGATCATTR: CCACCGGACGCGAAAGSnai2F:CACACAGTTATTATTTCCCCATATCTCTR:CGAGGTGAGGATCTCTGGTTTTSoat1F: AGAATATCCCACGAGTACTAAATGCAR: GGTACTGGTTGACTGTGGGTAGTGStat1F: TGAGCCCGACCCTATTACAAAAR: CCACGAAGGAGCTCTGAATGAZhx2F: AACTCACAGCAGACACTGATAGGAAR:TCAGAAGGATTTCAGCACAGACA。