CYP3A5基因SNP检测特异性引物、液相芯片和检测方法

摘要：

本发明公开了一种CYP3A5基因SNP检测液相芯片，主要包括有：对CYP3A5基因的SNP位点分别设计的ASPE引物对，每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成；分别包被有特异的anti-tag序列的微球；用于扩增具有A6986G、G14690A、2713127132insT、C3699T、和/或G19386A?SNP位点的CYP3A5基因目标序列的扩增引物。本发明还提供了使用上述液相芯片的检测方法以及CYP3A5基因SNP检测的特异性引物。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100％。所制备的CYP3A5基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应，可实现多个SNP位点的并行检测。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201010148424.4

申请日期：2010-04-09

公开/公告号：CN101812524A

公开/公告日：2010-08-25

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:广州益善生物技术有限公司

发明/设计人:许嘉森;朱泽尧

主申请人地址:510663 广东省广州市广州科学城揽月路80号广州科技创新基地B、C区五层

专利代理机构:广州华进联合专利商标代理有限公司 44224

代理人:万志香%曾旻辉

国别省市代码:广东;44

权利要求：

一种CYP3A5基因SNP检测液相芯片，其特征是，主要包括有：(A).针对CYP3A5基因的SNP位点分别设计的ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列分别为：针对A6986G位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12、针对G14690A位点的SEQ?ID?NO.13及SEQID?NO.14、针对27131_27132insT位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16、针对C3699T位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18、和/或针对G19386A位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20，所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1-SEQ?ID?NO.10中的序列；(B).分别包被有特异的anti-tag序列的微球，上述每种微球具有不同颜色编码；所述anti-tag序列选自SEQ?ID?NO.21～SEQ?ID?NO.30中的序列，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增具有A6986G、G14690A、27131_27132insT、C3699T、和/或G19386A?SNP位点的CYP3A5基因目标序列的扩增引物。