一个棉纤维特异性启动子GhFLA1的鉴定
本发明是一个棉纤维特异性启动子GhFLA1及其基因全序列,涉及一个棉纤维发育相关的重要调控元件。FLA1基因全长序列共1920bp,包括5’端启动子和基因编码序列。该基因不含内含子,编码一种阿拉伯半乳聚糖蛋白(AGP)。棉纤维中存在大量AGP蛋白,而AGP不可逆抑制剂能够抑制纤维伸长,表明该类蛋白对棉纤维发育有重要作用。FLA1基因mRNA在棉纤维细胞发育过程中特异性大量积累,表明该基因启动子对其纤维特异性表达有重要调控作用。实验还表明,该启动子在烟草叶表皮毛中具有很强的表达活性,进一步证实它是棉纤维特异性调控元件。这个启动子可作为基因顺式调控元件,应用于棉花分子育种研究以改良棉纤维品质,提高棉花产量。
发明专利
CN200910273465.3
2009-12-29
CN101818148A
2010-09-01
C12N15/113(2010.01)I
华中师范大学
李学宝;黄耿青;许文亮;龚思颖;李鹏
430079 湖北省武汉市洪山区珞瑜路152号
湖北武汉永嘉专利代理有限公司 42102
张安国
湖北;42
一个棉纤维特异性调控的GhFLA1基因上游启动子序列包括5’端未翻译区如下:??1?ATCTTATTTA?AAAACCATCG?AAATTTTTAT?TACTCAATCA?TTACCGAAAT?AGAATCGGGC?61?TAAAATATTT?CGAAAACTAA?AAGTTTCACT?TTTTATATTG?AAAAACGAGG?CTTTGTGATT121?CTTATAAATT?TAATTCATTG?AAATTTCATC?AAGTAAAATG?GAAGAATTAT?AAATCTCTAA181?AATGATAGAT?AAAAATGTCG?CAAATAAAGC?CATTGTGACA?CCCATTAAAG?GAGTCTTTCC241?CCATCCAGGG?GCTACCTTAC?CATATTCCGA?ATTCAATGGT?TTCAAAAAAT?CTCCTACAAC301?AATTCGTCTT?GGACTAGATC?TAGAACTACT?ATTAACGTTT?TGTGTAGCCA?TAAATCTTAT361?TTTGTATTCA?TTGAGATTTG?TTAACTTTGT?ATATCATTTC?ACTATAAATA?AACAATCTTA421?TCATAGACCC?ATTGTGATCA?TGAAATTATA?TAATAATGGA?AACAAAAACC?TTAGTTGCAA481?TCTCTATATC?TGATTTACTT?GTAAGTTTTA?CTAGGTACAC?CTTATATACT?GCTTTTGGGT541?AACTCTCTCA?ACAATTAAGA?GATCCATTCG?AGGAATACGG?GAAATAATTG?AAGAAACGAG601?CCTCCCCATA?TGTATGTCTA?TTTGGTCACA?TATCCACTCC?AAAATCTACT?CTGTTTTCCC661?TGCTTTTCCA?AGCAATGTAG?TTGCTCATCA?ATTTCTTTCC?TTTAA?AAATCCCAAC721?AGAGTTTGCT?AAAGTTGATA?AGTATGTCTT?CTAGTTAACT?AAAGTAGCAT?ATTTTACCTA781?ACTTCACCCT?CCAATATCCAAG?CTCCCATTTC?TTATCCAATC?AAACATCCA841?TAACATTTTT?GTTCAAGGAC?CACTTCTTCC?CTTCCATTTT?ACTTTGTTTT?AGTTGCCATA901?ACGTCACCTT?CCAATACAAC?CCACAFLA1启动子序列长度为925bp;利用NNPP预测转录起始位点,用PlaceCARE预测可能的调控元件;结果如下:方框为假定的转录起始位点,灰色底纹字母为假定的CAAAT框,而黑色底纹的字母为假定的TATA框。F2009102734653C00011.tif,F2009102734653C00012.tif,F2009102734653C00013.tif,F2009102734653C00014.tif