RNA干扰的目标碱基序列的搜索方法
本发明涉及RNA干扰的目标碱基序列的搜索方法。本发明从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)-(d)的序列部位，根据搜索结果进行能够产生RNA干扰的小干扰RNA(siRNA)的设计、合成等。(a)3’末端的碱基是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。(b)5’末端的碱基是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)。(c)3’末端的7碱基序列中富含由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)组成的群组中选择的1或1种以上的碱基。(d)碱基数在产生RNA干扰且不产生细胞毒性的范围内。
发明专利
CN200910266325.3
2003-11-21
CN101914532A
2010-12-15
C12N15/113(2010.01)I
生物智囊团株式会社
西乡薰;程久美子;内藤雄树
日本东京都
北京市柳沈律师事务所 11105
岑晓东
日本;JP
双链多核苷酸，通过以下方法合成：i)从RNA干扰的目标基因的碱基序列中搜索符合下述规则(a)?(d)、碱基数为19的序列部位，(a)正义链3’末端的碱基是腺嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶，(b)正义链5’末端的碱基是鸟嘌呤或胞嘧啶，(c)正义链3’末端的7碱基序列中7个碱基中至少4个是由腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶组成的群组中选择的1或1种以上的碱基，且(d)碱基数为19，其中搜索到的目标序列具有如下通式，5’?S?NNNNNNNNNNN?XXXXXX?W?3’3’?S?NNNNNNNNNNN?XXXXXX?W?5’S是G或C，N是G、C、A、T或U，至少3个X是A、T或U，W是A、T或U，ii)通过在其3’末端设一2个碱基的突出部来形成正义链；并iii)通过在其3’末端设一2个碱基的突出部来形成反义链，其中每条链的碱基数目为21。