RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用

摘要：

本发明涉及生物信息学领域，具体涉及一种RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用，包括如下步骤：选定外参基因；制备外参基因的mRNA与DNA，配制外参基因的mRNA与DNA的预混合液；在抽提样品时加入预混合液，收集样品中的总mRNA和DNA部分；实时定量荧光PCR，计算待测基因和外参基因mRNA和DNA的拷贝数；数据处理和归一化。本发明还公开了上述方法在基因芯片分析基因表达技术中的应用。本发明改进了对基因转录水平检测的实验设计，可以得到某个基因的真实的转录水平而不是一个相对水平，为基因表达数据和基因拷贝数据的整合提供新的概念和框架。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN200910049306.5

申请日期：2009-04-14

公开/公告号：CN101538611

公开/公告日：2009-09-23

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:上海生物信息技术研究中心

发明/设计人:陆长德;李园园

主申请人地址:200235上海市徐汇区钦州路100号2号楼4楼

专利代理机构:上海光华专利事务所

代理人:许亦琳%余明伟

国别省市代码:上海;31

权利要求：

1.一种RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法，包括如下步骤：1)配制外参基因的mRNA与外参基因的DNA的预混合液；2)将待测样品与步骤1)中制备的预混合液混合，分别抽提并且收集总mRNA和总DNA；3)总mRNA进行逆转录合成第一条cDNA链后与总DNA分别进行实时定量荧光PCR，然后计算扩增后待测基因的mRNA和DNA的拷贝数以及外参基因的mRNA和DNA的扩增产物的拷贝数。