UGT1A1基因扩增用引物对、含有其的UGT1A1基因扩增用试剂及其用途
提供用于通过基因扩增法扩增UGT1A1基因中含有检测目标部位的目标区域的引物对,该引物对可以特异性扩增前述区域。使用3对引物对,各个引物对分别包含含有序列号4或序列号81、序列号21和序列号42的碱基序列的正向引物、和含有序列号13或序列号91、序列号29和序列号48的碱基序列的反向引物。通过使用这种引物对,可以在同一反应液中,同时扩增UGT1A1基因的分别含有3种多态性(UGT1A1*6,UGT1A1*27,UGT1A1*28)发生部分的3个目标区域。
发明专利
CN200780030316.3
2007-11-29
CN101506362
2009-08-12
C12N15/00(2006.01)I
爱科来株式会社
平井光春;间岛智史
日本京都府
北京林达刘知识产权代理事务所
刘新宇%李茂家
日本;JP
1. 一种UGT1A1基因扩增用引物对,其特征在于,该引物对为用于通过基因扩增法扩增UGT1A1基因的引物对,含有选自下述引物对(1)~(3)所组成的组中的至少一种引物对:引物对(1):包含含有下述(F1)的寡核苷酸的正向引物和含有下述(R1)的寡核苷酸的反向引物的一个引物对:(F1):下述寡核苷酸中的至少一个:与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2120位的腺嘌呤碱基(A)作为第1个碱基朝着5’方向直至第18~22个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以所述腺嘌呤碱基(A)作为3’末端,和与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2140位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基朝着5’方向直至第18~34个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以所述胞嘧啶碱基(C)作为3’末端;(R1):下述寡核苷酸中的至少一个:与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2226位的鸟嘌呤碱基(G)作为第1个碱基朝着3’方向直至第17~27个碱基的区域互补的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以与所述第2226位的鸟嘌呤碱基(G)互补的胞嘧啶碱基(C)作为3’末端,和与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2198位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基朝着3’方向直至第22~39个碱基的区域互补的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以与所述第2198位的胞嘧啶碱基(C)互补的鸟嘌呤碱基(G)作为3’末端;引物对(2):包含含有下述(F2)的寡核苷酸的正向引物和含有下述(R2)的寡核苷酸的反向引物的一个引物对:(F2):与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2622位的鸟嘌呤碱基(G)作为第1个碱基朝着5’方向直至第15~27个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以所述鸟嘌呤碱基(G)作为3’末端,(R2):与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第2687位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基朝着3’方向直至第17~26个碱基的区域互补的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以与所述第2687位的胞嘧啶碱基(C)互补的鸟嘌呤碱基(G)作为3’末端;引物对(3):包含含有下述(F3)的寡核苷酸的正向引物和含有下述(R3)的寡核苷酸的反向引物的一个引物对:(F3):与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第1863位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基朝着5’方向直至第17~31个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以所述胞嘧啶碱基(C)作为3’末端,(R3):与含有序列号1的碱基序列的UGT1A1基因中的、以第1928位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基朝着3’方向直至第16~20个碱基的区域互补的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以与所述第1928位的胞嘧啶碱基(C)互补的鸟嘌呤碱基(G)作为3’末端。